Die Zeit der Saints läuft ab! Athena und ihre Saints wiegen sich nach ihrem letzten Sieg in Sicherheit. Doch der mächtige Chronos hat nur eins im Sinn: Rache an den Saints und an Zeus. Der finstere Gott der Zeit wird erst zufrieden sein, wenn er die Helden mit Hilfe seiner gefährlichen Häscher, den Stunden, vernichtet hat. Doch die Krieger des Zodiac sind nicht bei voller Stärke. Den Moiren ist es gelungen, Ikkis Schicksal mit dem seines Bruders zu tauschen. Jetzt müssen sich die Saints nicht nur gegen Chronos wehren, sondern auch Shun davor bewahren, die nächste Reinkarnation des Hades zu werden!